JR九州は、「ピクミン」シリーズとのタイアップイベント「MISSION.01 ピクミンフェスタ in 宮崎」開催にあわせ、「特急ピクミン号」を運転。運転日は、2025年4月19日(土)、20日(日)。運転区間は、1号が大分(9:36発)~宮崎(12:59着)、2号が鹿児島中央(10:20発)~宮崎(12:45着)、4号が宮崎(15:09発)~大分(18:42着)、3号が宮崎(16:49発)~鹿児島中央(19:11着)。使用車両は、1・4号が「ピクミントレイン」の885系6両編成(SM-5編成)、2・3号が同787系4両編成(Bo-6106編成)。乗車特典として、記念乗車証をプレゼント。
